Исследователи разрабатывают метод быстрого и точного обнаружения вирусов. - PSORDOC

Исследователи разрабатывают метод быстрого и точного обнаружения вирусов.

Исследователи из Critical Analytics for Manufacturing Personalized-Medicine (CAMP), междисциплинарной исследовательской группы (IRG) Альянса исследований и технологий Сингапура и Массачусетского технологического института (SMART), исследовательского предприятия Массачусетского технологического института в Сингапуре, разработали новый метод быстрого и точного обнаружения вирусных нуклеиновых кислот — прорыв, который можно легко адаптировать для обнаружения различных мишеней ДНК / РНК в таких вирусах, как коронавирус.

Пандемия подчеркнула важность быстрой диагностики и усовершенствованных методов обнаружения вирусов, особенно в свете того, что мир стремится быть готовым к будущим пандемиям или появлению следующего опасного патогена. В частности, индустрия биопроизводства, сталкивающаяся с уникальными проблемами использования клеток в качестве продуктов клеточной терапии, ищет инноваций в быстрых методах обнаружения вирусного заражения в рамках своих процессов контроля качества и тестирования выпуска. Хотя количественная полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (RT-qPCR) считается золотым стандартом для обнаружения вирусов, существуют ограничения, и они часто могут давать переменные результаты.

Более точной версией является метод цифровой ПЦР, который позволяет проводить абсолютную количественную оценку — то есть выявлять количество копий вирусов в образце — может позволить установить четкие пороги заражения вирусом и не подвержен потенциальным колебаниям эталонного гена, необходимого для стандартной количественной ПЦР. методы. Однако цифровая ПЦР требует относительно длительного времени реакции — около четырех часов. Еще один недостаток всех современных методов, основанных на ПЦР, заключается в том, что они требуют дорогостоящего оборудования для точного контроля температуры и цикличности.

Новая методологическая разработка CAMP — RApid DIgital Crispr Approach (RADICA) — позволяет проводить абсолютное количественное определение вирусных нуклеиновых кислот за 40-60 минут изотермическим способом на водяной бане, прототипе и недорогом лабораторном оборудовании. Исследование команды объясняется в статье под названием « Цифровой метод на основе CRISPR для быстрого обнаружения и абсолютного количественного определения нуклеиновых кислот », недавно опубликованной в престижном журнале Biomaterials .

Метод RADICA был протестирован на синтетической ДНК / РНК SARS-CoV-2, а также на вирусе Эпштейна-Барра в культивируемых В-клетках и сыворотке пациентов. Исследователи говорят, что этот метод может быть адаптирован для обнаружения других видов вирусов и других типов образцов, таких как слюна и среды для культивирования клеток. RADICA также может отличить вирус от своих близких родственников.

«Это первый зарегистрированный метод обнаружения нуклеиновых кислот, использующий чувствительность изотермической амплификации и специфичность обнаружения на основе CRISPR в цифровом формате, что позволяет быстро и точно амплифицировать ДНК без трудоемких и дорогостоящих циклов термоциклирования», — говорит д-р. Сяолинь Ву, научный сотрудник SMART CAMP. «RADICA предлагает в четыре раза более быструю абсолютную количественную оценку по сравнению с традиционными методами цифровой ПЦР».

Команда использует извлеченную ДНК / РНК образца и делит 15 мкл реакции на тысячи независимых разделов. В каждом разделе ДНК / РНК амплифицируется и идентифицируется белком Cas12a, ферментом, который может превращать целевой сигнал в флуоресцентный сигнал. Это позволяет проводить абсолютную количественную оценку путем подсчета количества подсвеченных разделов, содержащих целевую ДНК / РНК.

«Прошлый год показал нам важность быстрого и точного обнаружения вирусов, и RADICA может помочь заполнить существующие пробелы в этой области», — говорит профессор Национального университета Сингапура Хэнри Ю, соавтор-корреспондент и ведущий исследователь SMART CAMP. . «Продукты клеточной терапии имеют очень короткий срок хранения, и пациенты обычно срочно нуждаются в лечении. Текущие тесты на стерильность требуют около 14 дней, что слишком медленно для клинических нужд, но RADICA сокращает этот процесс до нескольких часов».

(1729 публикаций на сайте)

(Пока оценок нет)
Загрузка...
Понравилась статья? Поделиться с друзьями:
Добавить комментарий

;-) :| :x :twisted: :smile: :shock: :sad: :roll: :razz: :oops: :o :mrgreen: :lol: :idea: :grin: :evil: :cry: :cool: :arrow: :???: :?: :!:

Содержание

Сообщить об опечатке

Текст, который будет отправлен нашим редакторам:

Adblock
detector